भगवान शंकर की कृपा प्राप्त करने के लिए शिवरात्रि पूजा विधि (Shivratri Puja Vidhi) का सही पालन करना अत्यंत महत्वपूर्ण है। सबसे पहले पूजा स्थान को साफ करके महादेव (Mahadev) की मूर्ति या शिवलिंग को स्थापित करें। मिट्टी या पीतल के लोटे में शुद्ध जल, गंगाजल (Ganges Water) और कच्चा दूध मिलाकर अभिषेक की तैयारी करें। पूजा सामग्री (Ritual Items) में चंदन, अक्षत, पुष्प और धूप-दीप का होना आवश्यक है। पूरी श्रद्धा के साथ "ॐ नमः शिवाय" मंत्र का उच्चारण करते हुए पूजा आरंभ करनी चाहिए।
शिवलिंग का अभिषेक (Anointment of Shivalingam) करने के लिए पंचामृत (Panchamrit) का उपयोग करना श्रेष्ठ माना जाता है, जो दूध, दही, घी, शहद और शक्कर के मिश्रण से बनता है। प्रत्येक वस्तु को अर्पित करते समय विशेष मंत्रों का जप करना चाहिए। दूध से अभिषेक करने पर शांति (Peace) प्राप्त होती है, जबकि शहद से अभिषेक करने पर जीवन के कष्ट दूर होते हैं। शिवरात्रि पूजा विधि (Shivratri Puja Vidhi) में शुद्ध जल की धारा निरंतर शिवलिंग पर चढ़ाना मन की एकाग्रता (Concentration) को बढ़ाता है।
महादेव को बेलपत्र (Belpatra) चढ़ाना इस पूजा का सबसे अनिवार्य हिस्सा है, क्योंकि तीन पत्तियों वाला बेलपत्र त्रिगुणों (Three Qualities) का प्रतीक है। बेलपत्र अर्पित करते समय ध्यान रखें कि वह कटा-फटा न हो और उसकी कोमल सतह शिवलिंग (Lingam) की ओर हो। शिवरात्रि पूजा विधि (Shivratri Puja Vidhi) में धतूरा, भांग और शमी के पत्ते चढ़ाने का भी विशेष महत्व है। ये वस्तुएं भगवान शिव को अत्यंत प्रिय हैं और भक्तों के सभी पापों (Sins) का नाश करती हैं।
रात्रि के चारों पहरों की पूजा (Four Watches Prayer) का विधान शिवरात्रि के दिन विशेष रूप से फलदायी होता है। प्रत्येक पहर में अलग-अलग द्रव्यों (Liquids) से अभिषेक किया जाता है और शिव चालीसा या रुद्राष्टकम का पाठ (Recitation) किया जाता है। शिवरात्रि पूजा विधि (Shivratri Puja Vidhi) में अखंड जोत जलाना और भगवान की आरती करना पूजा को पूर्णता प्रदान करता है। ध्यान और योग (Yoga) के माध्यम से महादेव के साथ जुड़ना ही इस पूजा का वास्तविक लक्ष्य है।
अभिषेक (Anointment) के अंत में भस्म का लेपन करना शिव की वैराग्य शक्ति (Power of Detachment) को दर्शाता है। पूजा के बाद प्रसाद वितरण (Distribution of Offerings) करना चाहिए और सभी के कल्याण की कामना करनी चाहिए। शिवरात्रि पूजा विधि (Shivratri Puja Vidhi) सरल होने के साथ-साथ अत्यंत शक्तिशाली है, जो भक्त के भीतर भक्ति भाव (Devotion) को प्रगाढ़ करती है। भोलेनाथ (Bholenath) को प्रसन्न करने के लिए किसी आडंबर की नहीं, बल्कि केवल निर्मल हृदय (Pure Heart) की आवश्यकता होती है।